Pri izbiri popolnoma avtomatske centrifuge je treba upoštevati naslednje dejavnike:
Hitrost vrtenja in centrifugalna sila: različni vzorci zahtevajo različne hitrosti vrtenja; izbira mora temeljiti na dejanskih potrebah.
Kapaciteta: Kapaciteta bobna določa količino vzorca, obdelanega na cikel; industrijske aplikacije običajno zahtevajo večje zmogljivosti.
Material: korozijsko-odporni materiali (kot je nerjavno jeklo) so primerni za obdelavo kemičnih reagentov ali jedkih vzorcev.
Vzdrževanje in čiščenje: Preprost dizajn olajša vsakodnevno vzdrževanje in čiščenje.