Specializirana centrifuga je zaradi vitke gredi in prožne podpore vzmetenja relativno visoka. Med namestitvijo je treba okoli centrifuge zagotoviti dovolj prostora za delovanje in vzdrževanje, nad njo pa mora biti dovolj prostora. Zagotoviti je treba opremo za dvigovanje, ki olajša razstavljanje in sestavljanje vrtečih se delov med vzdrževanjem.
Zaradi podpore vzmetenja je treba med montažo zagotoviti navpičnost glavne gredi. Uporabite nivo 0,2/1000 za kalibracijo gredi glede na ravnino namestitve motorja. Nato pritrdite podnožje ali okvir in preverite, ali je glavna gred navpična, tj. poravnana z ohišjem centrifuge.
Električno krmilno omarico specializirane centrifuge je treba namestiti v nadzorni sobi blizu delovnega območja. Upoštevati je treba okoljske zahteve, kot so prezračevanje, suhost in odsotnost korozije v parni fazi. Pri uporabi krmiljenja s frekvenčnim pretvornikom so potrebni klimatska naprava in izpušni ventilatorji, da se zagotovi normalno delovanje električnih komponent med pogostimi povečanji in padci hitrosti centrifuge.